Es existieren zwei morphologische Erscheinungsformen dieser Darmamöbe: Einmal treten sie in Form infektiöser Zysten auf, deren Charakteristikum vier Kerne sind. Die Magnaform ist etwa 20–60 μm lang und phagozytiert Erythrozyten. Befällt E. histologica die Leber, kommt es zu einer Gewebenekrotisierung.