Die Schleimhaut (Mucosa) des Dünndarms ist fingerförmig ausgestülpt. Dadurch wird die Oberfläche ungemein vergrößert und es können mehr Nährstoffe aufgenommen werden. Real sind die Zotten bis 1,5 mm hoch. Insgesamt gibt es etwa vier Millionen davon. Weiter unten befinden sich die Submukosa-Schicht und die Muskelschicht (Muscularis mucosae, glatte Muskulatur).
