Die Ätiologie der Acne inversa ist nicht vollständig geklärt. Genetische Faktoren spielen eine Rolle, da die Erkrankung familiär gehäuft auftritt. Dabei scheint es sich um einen autosomal-dominanten Erbgang mit hoher Penetranz zu handeln. Der zugrunde liegende genetische Defekt soll sich in der Region 1p21.1–1q25.3 befinden.
Darüber hinaus gibt eine Reihe von Faktoren, die den Krankheitsverlauf begünstigen bzw. zum Ausbruch der Krankheit führen:
Die Zusammensetzung der bakteriellen Besiedelung der Haut - insbesondere die Kolonisation mit Staphylococcus aureus - beeinflussen die Schwere des Krankheitsverlaufs. Die Acne inversa kann mit Autoimmunerkrankungen assoziiert sein.